SNPstream是一个自动化的多元系统，在384孔板上的每一个孔中，既可以处理12个SNP样品，又可以处理48个SNP样品。不论用户的研究目标是低通量还是高通量，此系统对于每一个样品的成本是相同的。在SNP引物与预扩增的DNA杂交后，标记了的终止碱基就会在目标SNP位点延伸引物。延伸了的引物就会被SNPware Tag Array板捕获并被检测出来。在SNPware Tag Ar-ray板上可以同时进行多元反应，板上的384孔中的每一个孔中有16个或52个已知序列或标签的独一无二的寡核苷酸，板上的每一个标签与12个或48个延伸引物栎签之一互补．其余4个对照是为了确保其准确性。与为每个待测SNP个性化定制的微阵列板相比，此基于标签的方法充分运用了普通微阵列板的大体积与低制造成本的特点，在成本、基因型及反应体积的缩减方面，PCR与SNP-IT标签微阵列相结合的多路技术取得了重大的进步，而且初步的使用提示多路技术与扩充微阵列的进一步增加将会使基因组和大范围内的种群SNP基因分型日益实用化。在结果的一致性与准确性方面，有文献报道，在一组盲测实验中，将大约7800个UHT基因型与那些通过DNA测序已定的基因型进行比较分析，结果显示与已知基因型的一致性达到99. 5%。