起始于20世纪90年代初期的单链构象多态性(single strand conformationpolymorphism，SSCP)是较为流行的一种突变检测法(Orita et a1．，1989)。此方法是凭借单一碱基置换引发的突变型单链DNA三维构象的改变，通过观察单链DNA电泳迁移率的漂移来判断突变。其策略是：将PCR扩增的待测片段变性解链后，通过非变性聚丙酰胺凝胶电泳分离，比较待测单链DNA与无突变参照片段的电泳迁移率，完成对SNP的检测。但PCR-SSCP技术的SNP检测率只有50%～80%，而且为了确保检测效率，SSCP的最适检测长度仅为100～300bp。