从20世纪90年代后期，检测技术开始飞速发展，检测STR等位基因的方法更加灵敏、快速、准确。同时，可复合扩增大量STR，从银染系统的3、4个复合扩增到15个STR的多色荧光标记。
美国CODIS采用的13个核心基因座，促进这些STR遗传标记复合扩增的发展。在世纪交替之际，要得到全部I3个STR的信息需两个PCR反应：PowerPlex
®1.1和PowerPlex
®2.1，或Profiler Plus
TM和COfiler
TM。为了减少样本混淆的可能性，作为内部检测，试剂盒产品包含重叠的基因座，以便扩增相同来源的生物检材时获得相同的数据。Ptofiler Plusr
TM和COfler
TM共有基因座为D3S1358 、D7S820，PowerPlex
®1.1、PowerPlex
®2.1共有基因座为TH01、TPOX、VWA。
自从2000年开始，Promega和AB公司都推出了复合PCR反应产品，在单个反应中同时扩增13个STR并加人性别分型标记和两个额外的基因座。PowerPlex~ 16的电泳片段分离PCR产物是可视的彩色基因座图，各种颜色交替。AB公司的AmpFlSTR
® Identifiler丁M试剂盒等位基因ladder。
在技术章节中将会讨论现代法医DNA实验室分离检测荧光标记STR等位基因的两种基本方法。上述试剂盒通常使用ABI毛细管电泳系统310或3100遗传分析仪进行分析。有一些PowerPlex试剂盒可以用日立FMBIOⅡ扫描仪分析。
商品化的STR试剂盒是经过大量研究后选择确定的遗传标记，并分析了引物对之间能否匹配和它们在复合扩增中能否联合使用（Wallin et al．，2002; Krenke et al，，2002）。Promega公司发布和申请了他们PCR引物序列的专利（Masibay et al．，2000; Krenke et a1．，2002）。尽管一些引物序列信息已经为大众所知，AB公司仍保留引物序列的所有权。早期的法庭案件中，由于无法说明试剂盒的引物序列，STR技术不为法庭所采纳，现在不再有这些问题。
大多数实验室没有时间或来源进行引物设计、PCR复合条件优化和引物合成的质控。广泛使用的试剂盒和其条件，增加了实验室间共享数据的机会，无惧无效的等位基因。在包含的基因座、联合使用的荧光染料、标记的DNA链、提供的等位基因ladder及PCR扩增时使用的引物等方面，现已使用的STR复合系统均有所区别。需要谨记的是商业试剂盒快速指明了多数法医实验室可选用的STR。
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