由于存在遗传突变，在亲子鉴定研究中必须考虑突变因素。STR基因座的突变率为每一千次减数分裂中发生1～4次或0.1%～0.4%(见附图）。美国血库协会（AABB）已经针对亲缘关系鉴定中的突变情况制定了标准。AABB标准认为突变是遗传中自然发生的，标准5.4.2指出每个基因座的突变率必须记录在案。另外，标准6.4.1重点指出若仅有单DNA基因座排除，不能做出非父排除的结论。

    亲子鉴定实验室普遍接受“双排除”原则。换言之，如果被控父亲与孩子有两个遗传基因座不符合遗传规律，那么被控父亲也不能排除为这个孩子的生物学父亲。我们需谨记：检测的遗传系统越多，检测到随机突变的概率越大。由于STR分析通常检验12个或更多个基因座，故孩子和其真正的生物学父亲之间存在2个突变也就不足为奇了。

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