反转亲子鉴定是指一类父母已确定，检验孩子是否他们亲生的亲子鉴定，主要见于失踪者（活体、尸体）的身体确定。

 最典型的反转亲子鉴定是替被拐卖儿童寻找亲生父母。2000年公安部开展的“打击拐卖妇女、儿童专项斗争”通过全国范围内的DNA信息联网，用亲子鉴定技术替许多被拐卖儿童找到了自己的亲生父母。作者曾遇一例，三对夫妇在相近时间内各自丢失一名1岁左右的男孩，1年以后，转辗找回1男孩，三对夫妇均认为是自己的孩子。经鉴定，男孩是其中一对夫妇的。

 寻找被拐卖儿童，往往是一对父母与多个孩子或一个孩子与几对父母比对，找出有血缘关系的个体，类似于一种双盲检测，难度大于有特定对象的三联或二联鉴定。故需要检测更多的遗传标记，如只检测STR基因座，一般须检测13个以上基因座。

 目前由于罪犯的狡猾，作案手段的残忍，反转亲子鉴定在个人识别上的作用也日渐增大。曾有一例，某人失踪，在一嫌疑对象的床板上发现血迹，将此血迹与失踪者父母鲜血作亲子鉴定，确认血迹是失踪者的。

 根据孟德尔遗传定律，由已知双亲的遗传标记可推测子女可能有及不可能有的遗传标记，因此反转亲子鉴定的原理与其它类亲子鉴定一样。假设孩子具有双亲均无的遗传标记，可排除他们之间有亲子关系。假设孩子与双亲的遗传标记不违反遗传规律，可能有亲生关系。PI值可以按照双亲皆疑方法计算，也可以将假设孩子与父、假设孩子与母分别按单亲检测算。

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