在亲子鉴定的标准中首先应设立的鉴定标准为亲子鉴定关系的认定标准。因为认定或排除亲子关系是亲子鉴定的根本目的与要求。，早期国际法医学界采纳Essen-Moller的意见，把亲子鉴定关系概率（RCP，rnlative chance paternity）值作为认定亲生关系的依据，并把RCP≥99.73%判定为可疑肯定有亲子关系。但是，根据基因频率分布数据对检测结果进行数量化分析时，所得出的认定概率永远不可能是100%。于是又作者提出对所采用的遗传标记系统也应设立标准，即非父排除率（PE），并用累计非父排除率值来评估所采用的遗传标记系统排出无关男子父权的能力。一般来讲，测试的人愈多，CPE值增加渐趋平稳。故某些作者认为，花许多钱，非很长时间，加测许多遗传标记，只能略微增加CPE值，并不值得。据报道，轨迹法医学界也以CPE≥99.5%作为评判亲子鉴定实验室认定亲子关系的一个指标。